本校校徽設計意念，著重在發揚馬鳴村先民篳路籃縷的開墾及致力後代教育的精神。

背景以鮮紅色代表活潑有朝氣，由馬強而有力的身軀，眼睛炯炯有神，張開嘴巴嘶吼。

飛馳躍進一個圓，代表生生不息，活力永存之意義，以淺綠色為書本，再以黑色明顯標記[馬鳴]二字，

綠色代表寧靜祥和，意指學子能於動靜之中學習知識學問。

整體代表馬鳴國小學生靜如處子，動如天馬於德、智、體、群、美並進學習，造就一個活活潑潑的好學生，將來成為堂堂正正的好國民。